Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LRRTM2O43300 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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LRRTM2O43300 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LRRTM2O43300 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LRRTM2O43300 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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