Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PHF1O43189 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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