Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms