Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms