Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms