Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms