Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms