Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms