Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms