Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138902.1-201ENST00000437965 856 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003392.3-201ENST00000531886 667 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms