Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms