Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOL6Q9BWW8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms