Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms