Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms