Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOPBP1Q92547 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms