Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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