Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KLHDC9Q8NEP7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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