Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms