Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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