Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNE4Q8N205 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms