Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms