Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms