Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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