Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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TCF23Q7RTU1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TCF23Q7RTU1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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