Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q7L0L9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms