Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms