Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCTD18Q6PI47 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms