Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms