Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms