Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms