Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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