Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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