Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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