Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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