Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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