Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms