Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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