Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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SKIV2LQ15477 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKIV2LQ15477 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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