Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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