Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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