Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ALKBH1Q13686 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ALKBH1Q13686 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms