Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CALCOCO2Q13137 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CALCOCO2Q13137 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CALCOCO2Q13137 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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