Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms