Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
STX4Q12846 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
STX4Q12846 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
STX4Q12846 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
STX4Q12846 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
STX4Q12846 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
STX4Q12846 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
STX4Q12846 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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STX4Q12846 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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