Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TROQ12816 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TROQ12816 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TROQ12816 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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