Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms