Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP2Q08AD1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP2Q08AD1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms