Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms