Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms