Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms